PAÜ .:. Eğitim Öğretim Bilgi Sistemi

Yazdır

DERS BİLGİLERİ

Ders Kod	Ders Ad	T+U Saat	Yarıyıl	AKTS
BMM 207	BİYOİNFORMATİGE GİRİŞ	3 + 0	8. Yarıyıl	4

DERS TANIMI

Ders Düzeyi	Lisans
Ders Türü	Seçmeli
Dersin Amacı	Bu ders kapsamında, biyolojik veritabanlarının ve bazı biyoinformatik araç ve yaklaşımların DNA-RNA ve protein arasındaki bilgi akışının daha iyi anlaşılabilmesi amacıyla araştırılması ve tartışılması amaçlanmaktadır.
Ders İçeriği	Dizilerin karşılaştırılması, filogenetik ağaç kurulumu, türler arasındaki uzaklığın hesaplanması, mikroarray verilerinin değerlendirilmesi, genomik ve proteomik yaklaşımlar bu dersin kapsamındadır.
Ders Ön Koşul	Dersin ön koşulu yok.
Ders Yan Koşul	Dersin yan koşulu yok.
Öğretim Sistemi	Yüz Yüze

DERS ÖĞRENME KAZANIMLARI

1	Bilgi akışı nasıl yapılır sorusunun cevaplanabilmesi
2	Proteomikler hakkında genel bilginin kavranması
3	Genemikler hakkında genel bilginin kavranması
4	DNA-RNA ve filogenetik ağaç yapımı hakkında genel bilginin kavranması
5	Mikroarray verilerinin değerlendirilmesi

DERS ÖĞRENME KAZANIMININ PROGRAM YETERLİLİKLERİNE KATKISI

No	PY 01	PY 02	PY 03	PY 04	PY 05	PY 06	PY 07	PY 08	PY 09	PY 10	PY 11	PY 12	PY 13	PY 14
ÖK 001	5	3	3	3	4	4	4	3	4	4	3	2	4	3
ÖK 002	5	4	4	3	4	3	3	3	3	3	2	2	3	3
ÖK 003	4	2	4	1	4	3	3	3	3	3	2	2	2	2
ÖK 004	5	3	3	2	3	2	3	3	3	3	2	2	3	3
ÖK 005	5	3	3	2	3	2	3	3	3	3	2	2	3	3
Ara Toplam	24	15	17	11	18	14	16	15	16	16	11	10	15	14
Katkı	5	3	3	2	4	3	3	3	3	3	2	2	3	3

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

Etkinlik	Sayısı	Süresi (Saat)	Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi(14 hafta/teorik+uygulama)	14	3	42
Arasınavlar(hazırlık süresi dahil)	1	20	20
Yarıyıl Sonu Sınavı(hazırlık süresi dahil)	1	20	20
İnternette Tarama/ Kütüphane Çalışması	1	20	20
Pratik Çalışma	1	2	2
Toplam İş Yükü Dersin AKTS Kredisi			104 4

DERS ŞUBELERİ

Dönem seçiniz :

	Ders Dönemi	Şube No	Dersi Veren Öğretim Elemanı
Detay	2021-2022 Bahar	2	MELTEM BALABAN
Detay	2021-2022 Güz	2	MELTEM BALABAN

Yazdır

Ders Şube Detayları

Dersin Kodu	Dersin Ad	Saat (T+P)	Şube No	Öğretim Dili	Şube Dönemi
BMM 207	BİYOİNFORMATİGE GİRİŞ	3 + 0	2	Türkçe	2021-2022 Bahar

Öğretim Elemanı	E-Posta	İç Hat	Ders Yeri	Devam Zorunluluğu
Öğr. Gör. MELTEM BALABAN	mbalaban@pau.edu.tr		TEK A0103	Dersin Devam Yüzdesi : %60

Amaç		Bu ders kapsamında, biyolojik veritabanlarının ve bazı biyoinformatik araç ve yaklaşımların DNA-RNA ve protein arasındaki bilgi akışının daha iyi anlaşılabilmesi amacıyla araştırılması ve tartışılması amaçlanmaktadır.
İçerik		Dizilerin karşılaştırılması, filogenetik ağaç kurulumu, türler arasındaki uzaklığın hesaplanması, mikroarray verilerinin değerlendirilmesi, genomik ve proteomik yaklaşımlar bu dersin kapsamındadır.

Haftalık Konu Başlıkları

Hafta	Konular
1	Biyoinformatiğe giriş-Python programlama dili
2	Python programlama dili
3	Python programlama dili
4	Python programlama dili
5	Python programlama dili
6	Python programlama dili
7	Python programlama dili
8	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları
9	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları
10	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları
11	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları
12	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları
13	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları
14	Biyoinformatik yöntemler/Python uygulamaları

Materyaller

Materyal belirtilmemiştir.

Kaynaklar

Kaynaklar	Kaynak Dili
PYTHON 3,Onur Sevli,KODLAB Yayın,2021	Türkçe
Uygulamalı Biyoinformatik Giriş,Paul M.Selzer,Richard J.Marhöfer,Oliver Koch,Palme Yayıncılık,2019	Türkçe
Mastering Python for Bioinformatics,Ken Youens-Clark,O'Reilly Media, Inc.,2021	English

Ders Değerlendirme Sistemi

T+U : Teorik + Pratik
PY: Program Yeterlilikleri
ÖK: Ders Öğrenme Kazanımları

Aday Öğrenci