1. LİSANS
  2. MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ
  3. BİLGİSAYAR MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ
  4. 253 BİLGİSAYAR MÜHENDİSLİĞİ
Ders Bilgileri Ders Öğrenme Kazanımları Dersin Program Yeterlilikerine Katkısı AKTS / İş Yükü Tablosu Ders Şubeleri
Yazdır

DERS BİLGİLERİ
Ders KodDers AdT+U SaatYarıyılAKTS
CENG 489BİYOİNFORMATİĞE GİRİŞ3 + 08. Yarıyıl5

DERS TANIMI
Ders Düzeyi Lisans
Ders Türü Seçmeli
Dersin Amacı Bu dersin amacı öğrencilere biyolojik veriler üzerinde hesaplama tekniklerini tanıtarak biyoinformatiğin güncel konularını kavratmaktır. Bu ders son dönemde bilgisayar biliminin en gözde araştırma konularından olan biyoinformatik alanındaki temel terminolojiyi ve problemleri tanıtmak ve bu problemlerin çözümü için geliştirilen algoritma, metot ve araçlar konusunda bilinirliği/farkındalığı sağlayacaktır.
Ders İçeriği Moleküler biyoloji ve genetiğin temel kavramları, İkili sıra hizalama algoritmaları, Çoklu dizi hizalama, Gizli Markov Modelleri, Gen Tahmini, Gibbs Sampling algoritması.
Ders Ön Koşul Dersin ön koşulu yok.
Ders Yan Koşul Dersin yan koşulu yok.
Öğretim Sistemi Yüz Yüze

DERS ÖĞRENME KAZANIMLARI
1Biyoinformatik ile ilgili problemleri tanımlar.
2Biyoinformatik ile ilgili algoritmaları ve veri yapılarını anlar ve karşılaştırır.
3Öğrencilerin alanlarındaki algoritma geliştirme tekniklerinin biyoinformatikte kullanmalarını sağlar.

DERS ÖĞRENME KAZANIMININ PROGRAM YETERLİLİKLERİNE KATKISI
NoPY 01PY 02PY 03PY 04PY 05PY 06PY 07PY 08PY 09PY 10PY 11PY 12
ÖK 001543    23455
ÖK 002 11343223455
ÖK 003  1212332211
Ara Toplam555555578101111
Katkı222222223344

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
EtkinlikSayısıSüresi (Saat)Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi(14 hafta/teorik+uygulama)14342
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme)14228
Arasınavlar(hazırlık süresi dahil)13030
Yarıyıl Sonu Sınavı(hazırlık süresi dahil)13030
Toplam İş Yükü

Dersin AKTS Kredisi





130

5
DERS ŞUBELERİ
 Dönem seçiniz :   


 Ders DönemiŞube NoDersi Veren Öğretim Elemanı
Detay 2020-2021 Güz1ŞEVKET UMUT ÇAKIR


Yazdır

Ders Şube Detayları
Dersin Kodu Dersin Ad Saat (T+P) Şube No Öğretim Dili Şube Dönemi
CENG 489 BİYOİNFORMATİĞE GİRİŞ 3 + 0 1 Türkçe 2020-2021 Güz
Öğretim Elemanı  E-Posta  İç Hat  Ders Yeri Devam Zorunluluğu
Öğr. Gör. ŞEVKET UMUT ÇAKIR sucakir@pau.edu.tr MUH A0226 Dersin Devam Yüzdesi : %
Amaç Bu dersin amacı öğrencilere biyolojik veriler üzerinde hesaplama tekniklerini tanıtarak biyoinformatiğin güncel konularını kavratmaktır. Bu ders son dönemde bilgisayar biliminin en gözde araştırma konularından olan biyoinformatik alanındaki temel terminolojiyi ve problemleri tanıtmak ve bu problemlerin çözümü için geliştirilen algoritma, metot ve araçlar konusunda bilinirliği/farkındalığı sağlayacaktır.
İçerik Moleküler biyoloji ve genetiğin temel kavramları, İkili sıra hizalama algoritmaları, Çoklu dizi hizalama, Gizli Markov Modelleri, Gen Tahmini, Gibbs Sampling algoritması.
Haftalık Konu Başlıkları
HaftaKonular
1 Biyolojiye Giriş
2 Sekans Hizalama
3 Sekans Hizalama
4 Sekans Hizalama
5 Sekans Hizalama
6 Filogenetik Ağaçlar
7 Protein Yapısı
8 Protein Yapısı
9 Protein Yapısı
10 Mikrodizi Veri Analizi
11 Mikrodizi Veri Analizi
12 Gen/Protein Ağları
13 Gen/Protein Ağları
14 Gen/Protein Ağları
Materyaller
Materyal belirtilmemiştir.
Kaynaklar
Ders Değerlendirme Sistemi
Değerlendirme YöntemiKatkı Yüzdesi (%)Değerlendirme Yöntemi Ad
Dönem Sonu Sınavı40Dönem Sonu Sınavı
Ara Sınav40Ara Sınav
Ödev20Ödev
T+U : Teorik + Pratik
PY: Program Yeterlilikleri
ÖK: Ders Öğrenme Kazanımları