Yazdır

DERS BİLGİLERİ
Ders KodDers AdT+U SaatYarıyılAKTS
KMB 803HÜCRESEL MOLEKÜLER MEKANİZMALAR ARAŞTIRMA YÖNTEMLERİ2 + 43. Yarıyıl3

DERS TANIMI
Ders Düzeyi Doktora
Ders Türü Seçmeli
Dersin Amacı Dokudan ve hücreden organel izolasyonunu, hücre kültürü ile yapılan çalışmalarının temel prensiplerini ve uygulama tekniklerini, protein ve gen ekspresyon analizi ile hücresel mekanizmaların izlenmesinde kullanılan moleküler yöntemlerin (WB, RT-PCR; IHC, HPLC, Flow sitometre) temel prensiplerini kapsamaktadır. Dersin programı doku, hücre hattı ve primer hücre kültürü kullanılarak elde edilen materyaller ile hücre içi protein ve gen ekspresyonlarının izlenmesini
Ders İçeriği 1 Santrifügasyonun temel prensipleri Uyg: Deney hayvanından (rat) KC ve aort doku eldesi 2 Hücrenin yapı ve organizasyonu, hücre organelleri ve santrifugasyon ile ayrımlanması Uygulama: KC dokusundan mitokondri izolasyonu ve doğrulanması 3 Hücre kültürü çalışmalarında temel bilgiler: - Laboratuvar gereksinimleri - Hücre kültürü laboratuvarında güvenlik - Hücre kültürü laboratuvarında sterilizasyon Uygulama: Temel ekipmanlar, lab. tasarımı, sterilizasyon 4 Hücrelerin ve hücre kültürünün sürekliliğinin sağlanması -Hücre tipleri -Besi ortamları ve içerikleri Uygulama: Besi ortamı seçimi, hazırlanması ve sterilizasyonu 5 Hücre canlılık ve dondurma teknikleri Uygulama: Hücre Dondurma, Hücre canlılık analizleri 6 Primer Hücre Kültürü Uygulama: Rat Aort dokusundan eksplant ve enzimatik yöntemle primer kültür eldesi 7 Protein Ekspresyon Analizi-I Uygulama: Immünhistokimya, Immunfluoresans 8 Protein Ekspresyon Analizi-II Uygulama: Western Blot Elektroforez ile hücre lizatlarında protein ekspresyon analizi 9 Protein Ekspresyon Analizi-III Uygulama: IEF ve ELISA 10 Gen Ekspresyon Analizi-I Kuramsal: Primer dizaynı, PZR temel bilgi, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi . Uygulama: Hücreden RNA izolasyonu ve kalite kontrolü (Nanodrop) 11 Gen Ekspresyon Analizi-II Uygulama: RNA cDNA, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi, jel görüntüleme. 12 Gen Ekspresyon Analizi-III Kuramsal: Gen ekspresyonunda yöntemler, Real-Time PZR, Kantitatif ve semi-kantitatif analiz. Uygulama: cDNA Real-Time PZR, veri analizi. 13 Hücre lizatlarında Metabolik Araştırmalar: Hücre içi Kolesterol Metabolitlerinin Analizi Uygulama: HPLC ile metabolit analizi
Ders Ön Koşul Dersin ön koşulu yok.
Ders Yan Koşul Dersin yan koşulu yok.
Öğretim Sistemi Yüz Yüze

DERS ÖĞRENME KAZANIMLARI
3KANSER MOLEKÜLER BİYOLOJİS,İNİ KAVRAMA

DERS ÖĞRENME KAZANIMININ PROGRAM YETERLİLİKLERİNE KATKISI
NoPY 01PY 02PY 03PY 04PY 05
ÖK 003     
Ara Toplam     
Katkı00000

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
EtkinlikSayısıSüresi (Saat)Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi(14 hafta/teorik+uygulama)13678
Toplam İş Yükü

Dersin AKTS Kredisi






78

3
DERS ŞUBELERİ
 Dönem seçiniz :   


 Ders DönemiŞube NoDersi Veren Öğretim Elemanı
Detay 2021-2022 Güz1HAKAN AKÇA
Detay 2019-2020 Güz1HAKAN AKÇA


Yazdır

Ders Şube Detayları
Dersin Kodu Dersin Ad Saat (T+P) Şube No Öğretim Dili Şube Dönemi
KMB 803 HÜCRESEL MOLEKÜLER MEKANİZMALAR ARAŞTIRMA YÖNTEMLERİ 2 + 4 1 Türkçe 2021-2022 Güz
Öğretim Elemanı  E-Posta  İç Hat  Ders Yeri Devam Zorunluluğu
Prof. Dr. HAKAN AKÇA hakca@pau.edu.tr TIP EB103 Dersin Devam Yüzdesi : %
Amaç Dokudan ve hücreden organel izolasyonunu, hücre kültürü ile yapılan çalışmalarının temel prensiplerini ve uygulama tekniklerini, protein ve gen ekspresyon analizi ile hücresel mekanizmaların izlenmesinde kullanılan moleküler yöntemlerin (WB, RT-PCR; IHC, HPLC, Flow sitometre) temel prensiplerini kapsamaktadır. Dersin programı doku, hücre hattı ve primer hücre kültürü kullanılarak elde edilen materyaller ile hücre içi protein ve gen ekspresyonlarının izlenmesini
İçerik 1 Santrifügasyonun temel prensipleri Uyg: Deney hayvanından (rat) KC ve aort doku eldesi 2 Hücrenin yapı ve organizasyonu, hücre organelleri ve santrifugasyon ile ayrımlanması Uygulama: KC dokusundan mitokondri izolasyonu ve doğrulanması 3 Hücre kültürü çalışmalarında temel bilgiler: - Laboratuvar gereksinimleri - Hücre kültürü laboratuvarında güvenlik - Hücre kültürü laboratuvarında sterilizasyon Uygulama: Temel ekipmanlar, lab. tasarımı, sterilizasyon 4 Hücrelerin ve hücre kültürünün sürekliliğinin sağlanması -Hücre tipleri -Besi ortamları ve içerikleri Uygulama: Besi ortamı seçimi, hazırlanması ve sterilizasyonu 5 Hücre canlılık ve dondurma teknikleri Uygulama: Hücre Dondurma, Hücre canlılık analizleri 6 Primer Hücre Kültürü Uygulama: Rat Aort dokusundan eksplant ve enzimatik yöntemle primer kültür eldesi 7 Protein Ekspresyon Analizi-I Uygulama: Immünhistokimya, Immunfluoresans 8 Protein Ekspresyon Analizi-II Uygulama: Western Blot Elektroforez ile hücre lizatlarında protein ekspresyon analizi 9 Protein Ekspresyon Analizi-III Uygulama: IEF ve ELISA 10 Gen Ekspresyon Analizi-I Kuramsal: Primer dizaynı, PZR temel bilgi, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi . Uygulama: Hücreden RNA izolasyonu ve kalite kontrolü (Nanodrop) 11 Gen Ekspresyon Analizi-II Uygulama: RNA cDNA, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi, jel görüntüleme. 12 Gen Ekspresyon Analizi-III Kuramsal: Gen ekspresyonunda yöntemler, Real-Time PZR, Kantitatif ve semi-kantitatif analiz. Uygulama: cDNA Real-Time PZR, veri analizi. 13 Hücre lizatlarında Metabolik Araştırmalar: Hücre içi Kolesterol Metabolitlerinin Analizi Uygulama: HPLC ile metabolit analizi
Haftalık Konu Başlıkları
Materyaller
Materyal belirtilmemiştir.
Kaynaklar
Ders Değerlendirme Sistemi
Değerlendirme YöntemiKatkı Yüzdesi (%)Değerlendirme Yöntemi Ad
Dönem Sonu Sınavı50Dönem Sonu Sınavı
Ara Sınav50Ara Sınav
T+U : Teorik + Pratik
PY: Program Yeterlilikleri
ÖK: Ders Öğrenme Kazanımları