Pamukkale Üniversitesi
Üniversite hayatın rehberidir
PAÜ'ye Hoşgeldiniz;
Aday Öğrenci
Öğrencilerimiz
Personelimiz
EN
Eğitim Bilgi Sistemi
Ana Sayfa
Üniversite Hakkında
İsim ve Adres
Yönetim
Genel Tanımlama
Akademik Takvim
Genel Kabul Gereksinimleri
Önceki Eğitimlerin Tanınması
Genel Kayıt İşlemleri
AKTS Kredilerinin Oluşturulması
Akademik Danışmanlık
Öğrenciler İçin
Yaşam Giderleri
Barınma
Beslenme / Yemek
Tedavi İmkanları
Engelli Öğrenci İmkanları
Sigorta
Maddi Destek
Öğrenci İşleri Birimi
Öğrenme İmkanları
Uluslararası Programlar
Dil Kursları
Stajlar
Spor ve Eğlence Olanakları
Öğrenci Toplulukları
Değişim Öğrencileri İçin Pratik Bilgiler
Derece Programları
DOKTORA
SAĞLIK BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ
KANSER MOLEKÜLER BİYOLOJİSİ ANABİLİM DALI
3683 KANSER MOLEKÜLER BİYOLOJİSİ DR.
Ders Bilgileri
Ders Öğrenme Kazanımları
Dersin Program Yeterlilikerine Katkısı
AKTS / İş Yükü Tablosu
Ders Şubeleri
Yazdır
DERS BİLGİLERİ
Ders Kod
Ders Ad
T+U Saat
Yarıyıl
AKTS
KMB 803
HÜCRESEL MOLEKÜLER MEKANİZMALAR ARAŞTIRMA YÖNTEMLERİ
2 + 4
3. Yarıyıl
3
DERS TANIMI
Ders Düzeyi
Doktora
Ders Türü
Seçmeli
Dersin Amacı
Dokudan ve hücreden organel izolasyonunu, hücre kültürü ile yapılan çalışmalarının temel prensiplerini ve uygulama tekniklerini, protein ve gen ekspresyon analizi ile hücresel mekanizmaların izlenmesinde kullanılan moleküler yöntemlerin (WB, RT-PCR; IHC, HPLC, Flow sitometre) temel prensiplerini kapsamaktadır. Dersin programı doku, hücre hattı ve primer hücre kültürü kullanılarak elde edilen materyaller ile hücre içi protein ve gen ekspresyonlarının izlenmesini
Ders İçeriği
1 Santrifügasyonun temel prensipleri Uyg: Deney hayvanından (rat) KC ve aort doku eldesi 2 Hücrenin yapı ve organizasyonu, hücre organelleri ve santrifugasyon ile ayrımlanması Uygulama: KC dokusundan mitokondri izolasyonu ve doğrulanması 3 Hücre kültürü çalışmalarında temel bilgiler: - Laboratuvar gereksinimleri - Hücre kültürü laboratuvarında güvenlik - Hücre kültürü laboratuvarında sterilizasyon Uygulama: Temel ekipmanlar, lab. tasarımı, sterilizasyon 4 Hücrelerin ve hücre kültürünün sürekliliğinin sağlanması -Hücre tipleri -Besi ortamları ve içerikleri Uygulama: Besi ortamı seçimi, hazırlanması ve sterilizasyonu 5 Hücre canlılık ve dondurma teknikleri Uygulama: Hücre Dondurma, Hücre canlılık analizleri 6 Primer Hücre Kültürü Uygulama: Rat Aort dokusundan eksplant ve enzimatik yöntemle primer kültür eldesi 7 Protein Ekspresyon Analizi-I Uygulama: Immünhistokimya, Immunfluoresans 8 Protein Ekspresyon Analizi-II Uygulama: Western Blot Elektroforez ile hücre lizatlarında protein ekspresyon analizi 9 Protein Ekspresyon Analizi-III Uygulama: IEF ve ELISA 10 Gen Ekspresyon Analizi-I Kuramsal: Primer dizaynı, PZR temel bilgi, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi . Uygulama: Hücreden RNA izolasyonu ve kalite kontrolü (Nanodrop) 11 Gen Ekspresyon Analizi-II Uygulama: RNA cDNA, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi, jel görüntüleme. 12 Gen Ekspresyon Analizi-III Kuramsal: Gen ekspresyonunda yöntemler, Real-Time PZR, Kantitatif ve semi-kantitatif analiz. Uygulama: cDNA Real-Time PZR, veri analizi. 13 Hücre lizatlarında Metabolik Araştırmalar: Hücre içi Kolesterol Metabolitlerinin Analizi Uygulama: HPLC ile metabolit analizi
Ders Ön Koşul
Dersin ön koşulu yok.
Ders Yan Koşul
Dersin yan koşulu yok.
Öğretim Sistemi
Yüz Yüze
DERS ÖĞRENME KAZANIMLARI
3
KANSER MOLEKÜLER BİYOLOJİS,İNİ KAVRAMA
DERS ÖĞRENME KAZANIMININ PROGRAM YETERLİLİKLERİNE KATKISI
No
PY 01
PY 02
PY 03
PY 04
PY 05
ÖK 003
Ara Toplam
Katkı
0
0
0
0
0
AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
Etkinlik
Sayısı
Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi(14 hafta/teorik+uygulama)
13
6
78
Toplam İş Yükü
Dersin AKTS Kredisi
78
3
DERS ŞUBELERİ
Dönem seçiniz :
Tüm Dönemler
2021-2022 Güz
2019-2020 Güz
Ders Dönemi
Şube No
Dersi Veren Öğretim Elemanı
Detay
2021-2022 Güz
1
HAKAN AKÇA
Detay
2019-2020 Güz
1
HAKAN AKÇA
Yazdır
Ders Şube Detayları
Dersin Kodu
Dersin Ad
Saat (T+P)
Şube No
Öğretim Dili
Şube Dönemi
KMB 803
HÜCRESEL MOLEKÜLER MEKANİZMALAR ARAŞTIRMA YÖNTEMLERİ
2 + 4
1
Türkçe
2021-2022 Güz
Öğretim Elemanı
E-Posta
İç Hat
Ders Yeri
Devam Zorunluluğu
Prof. Dr. HAKAN AKÇA
hakca@pau.edu.tr
TIP EB103
Dersin Devam Yüzdesi : %
Amaç
Dokudan ve hücreden organel izolasyonunu, hücre kültürü ile yapılan çalışmalarının temel prensiplerini ve uygulama tekniklerini, protein ve gen ekspresyon analizi ile hücresel mekanizmaların izlenmesinde kullanılan moleküler yöntemlerin (WB, RT-PCR; IHC, HPLC, Flow sitometre) temel prensiplerini kapsamaktadır. Dersin programı doku, hücre hattı ve primer hücre kültürü kullanılarak elde edilen materyaller ile hücre içi protein ve gen ekspresyonlarının izlenmesini
İçerik
1 Santrifügasyonun temel prensipleri Uyg: Deney hayvanından (rat) KC ve aort doku eldesi 2 Hücrenin yapı ve organizasyonu, hücre organelleri ve santrifugasyon ile ayrımlanması Uygulama: KC dokusundan mitokondri izolasyonu ve doğrulanması 3 Hücre kültürü çalışmalarında temel bilgiler: - Laboratuvar gereksinimleri - Hücre kültürü laboratuvarında güvenlik - Hücre kültürü laboratuvarında sterilizasyon Uygulama: Temel ekipmanlar, lab. tasarımı, sterilizasyon 4 Hücrelerin ve hücre kültürünün sürekliliğinin sağlanması -Hücre tipleri -Besi ortamları ve içerikleri Uygulama: Besi ortamı seçimi, hazırlanması ve sterilizasyonu 5 Hücre canlılık ve dondurma teknikleri Uygulama: Hücre Dondurma, Hücre canlılık analizleri 6 Primer Hücre Kültürü Uygulama: Rat Aort dokusundan eksplant ve enzimatik yöntemle primer kültür eldesi 7 Protein Ekspresyon Analizi-I Uygulama: Immünhistokimya, Immunfluoresans 8 Protein Ekspresyon Analizi-II Uygulama: Western Blot Elektroforez ile hücre lizatlarında protein ekspresyon analizi 9 Protein Ekspresyon Analizi-III Uygulama: IEF ve ELISA 10 Gen Ekspresyon Analizi-I Kuramsal: Primer dizaynı, PZR temel bilgi, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi . Uygulama: Hücreden RNA izolasyonu ve kalite kontrolü (Nanodrop) 11 Gen Ekspresyon Analizi-II Uygulama: RNA cDNA, RT-PZR, agaroz jel elektroforezi, jel görüntüleme. 12 Gen Ekspresyon Analizi-III Kuramsal: Gen ekspresyonunda yöntemler, Real-Time PZR, Kantitatif ve semi-kantitatif analiz. Uygulama: cDNA Real-Time PZR, veri analizi. 13 Hücre lizatlarında Metabolik Araştırmalar: Hücre içi Kolesterol Metabolitlerinin Analizi Uygulama: HPLC ile metabolit analizi
Haftalık Konu Başlıkları
Materyaller
Materyal belirtilmemiştir.
Kaynaklar
Ders Değerlendirme Sistemi
Değerlendirme Yöntemi
Katkı Yüzdesi (%)
Değerlendirme Yöntemi Ad
Dönem Sonu Sınavı
50
Dönem Sonu Sınavı
Ara Sınav
50
Ara Sınav
T+U :
Teorik + Pratik
PY:
Program Yeterlilikleri
ÖK:
Ders Öğrenme Kazanımları
{1}
##LOC[OK]##
{1}
##LOC[OK]##
##LOC[Cancel]##
{1}
##LOC[OK]##
##LOC[Cancel]##
Ana Sayfa
Üniversite Hakkında
İsim ve Adres
Yönetim
Genel Tanımlama
Akademik Takvim
Genel Kabul Gereksinimleri
Önceki Eğitimlerin Tanınması
Genel Kayıt İşlemleri
AKTS Kredilerinin Oluşturulması
Akademik Danışmanlık
Öğrenciler İçin
Yaşam Giderleri
Barınma
Beslenme / Yemek
Tedavi İmkanları
Engelli Öğrenci İmkanları
Sigorta
Maddi Destek
Öğrenci İşleri Birimi
Öğrenme İmkanları
Uluslararası Programlar
Dil Kursları
Stajlar
Spor ve Eğlence Olanakları
Öğrenci Toplulukları
Değişim Öğrencileri İçin Pratik Bilgiler
Derece Programları