Yazdır

DERS BİLGİLERİ
Ders KodDers AdT+U SaatYarıyılAKTS
BIO 512BIYOİNFORMATİK3 + 02. Yarıyıl7,5

DERS TANIMI
Ders Düzeyi Yüksek Lisans
Ders Türü Seçmeli
Dersin Amacı Tüm biyoinformatiğin anahtar alanları olan biyolojik databazlar, sekans dizileri, gen ve promotor tahminleri, moleküler filogenetik, yapısal biyoinformatik, genomik ve protemik gibi temel alanları hakkında temel bilgiler vermektir.
Ders İçeriği Biyolojik sistemlere giriş, Biyolojik sekans databazları, Sekans karşılaştırmaları ve sekansa dayalı databaz araştırmaları, Yapısal Biyoinformatik, Eukaryotik Genomunu çözümü, Protein yapıları ve Yapıya dayalı uygulamaları, Sistem biyolojisi: Genomun fonksiyonel analizi. Karşılaştırılmalı Genom analizleri, Genomik and proteomik uygulamaları, Moleküler filogenetik, Gen and promotor tahmini.
Ders Ön Koşul Dersin ön koşulu yok.
Ders Yan Koşul Dersin yan koşulu yok.
Öğretim Sistemi Yüz Yüze

DERS ÖĞRENME KAZANIMLARI
1Biyolojik sekans databazları bilir
2Sekans karşılaştırmaları ve sekansa dayalı veri araştırmaları yapar
3Yapısal biyoinformatik bilir
4Eukaryotik genomunu çözer
5Protein yapıları ve yapıya dayalı uygulamaları bilir
6Sistem biyolojisi: genomun fonksiyonel analizi yapar
7Karşılaştırılmalı genom analizleri yapar

DERS ÖĞRENME KAZANIMININ PROGRAM YETERLİLİKLERİNE KATKISI
NoPY 01PY 02PY 03PY 04PY 05PY 06PY 07PY 08PY 09PY 10PY 11
ÖK 0014433   54  
ÖK 0024544 4445  
ÖK 00334555 54 55
ÖK 00455455 5 555
ÖK 00534555  55 5
ÖK 006           
ÖK 007           
Ara Toplam192221221541418191015
Katkı33332123312

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU
EtkinlikSayısıSüresi (Saat)Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Süresi(14 hafta/teorik+uygulama)14342
Sınıf Dışı Ders Çalışma Süresi(Ön çalışma, pekiştirme)14798
Ödevler155
Arasınavlar(hazırlık süresi dahil)11515
Yarıyıl Sonu Sınavı(hazırlık süresi dahil)13535
Toplam İş Yükü

Dersin AKTS Kredisi






195

7,5
DERS ŞUBELERİ
 Dönem seçiniz :   


 Ders DönemiŞube NoDersi Veren Öğretim Elemanı
Detay 2022-2023 Bahar1CANER VURAL
Detay 2021-2022 Bahar1CANER VURAL
Detay 2020-2021 Bahar1CANER VURAL


Yazdır

Ders Şube Detayları
Dersin Kodu Dersin Ad Saat (T+P) Şube No Öğretim Dili Şube Dönemi
BIO 512 BIYOİNFORMATİK 3 + 0 1 Türkçe 2022-2023 Bahar
Öğretim Elemanı  E-Posta  İç Hat  Ders Yeri Devam Zorunluluğu
Dr. Öğr. Üyesi CANER VURAL canerv@pau.edu.tr FEN B0318 Dersin Devam Yüzdesi : %70
Amaç Tüm biyoinformatiğin anahtar alanları olan biyolojik databazlar, sekans dizileri, gen ve promotor tahminleri, moleküler filogenetik, yapısal biyoinformatik, genomik ve protemik gibi temel alanları hakkında temel bilgiler vermektir.
İçerik Biyolojik sistemlere giriş, Biyolojik sekans databazları, Sekans karşılaştırmaları ve sekansa dayalı databaz araştırmaları, Yapısal Biyoinformatik, Eukaryotik Genomunu çözümü, Protein yapıları ve Yapıya dayalı uygulamaları, Sistem biyolojisi: Genomun fonksiyonel analizi. Karşılaştırılmalı Genom analizleri, Genomik and proteomik uygulamaları, Moleküler filogenetik, Gen and promotor tahmini.
Haftalık Konu Başlıkları
HaftaKonular
1 Biyoinformatiğe Giriş: Biyoinformatiğin Temelleri ve Tarihçesi
2 DNA Dizi Düzenleme ve Genlerin Birleştirilmesi
3 Biyolojik Veritabanları 1
4 Biyolojik Veritabanları 2
5 Dizi Karşılaştırmaları ve Dizi Tabanlı Veritabanı Aramaları
6 İkili Hizalama, Çoklu Hizalama ve BLAST
7 Primer Dizaynı
8 Protein Yapıları ve Yapı Temelli Rasyonel İlaç Tasarımı
9 Moleküler Dizi Verilerinin Filogenetik Analizi
10 Prokaryotların Dizi Temelli Sınıflandırılması ve Tanımlanması
11 Genomların Fonksiyonel Analizi 1
12 Genomların Fonksiyonel Analizi 2
13 Karşılaştırmalı Genom Analizleri
14 Karşılaştırmalı Metabolik Analizler
Materyaller
Materyal belirtilmemiştir.
Kaynaklar
Ders Değerlendirme Sistemi
Değerlendirme YöntemiKatkı Yüzdesi (%)Değerlendirme Yöntemi Ad
Dönem Sonu Sınavı50Dönem Sonu Sınavı
Ara Sınav50Ara Sınav
T+U : Teorik + Pratik
PY: Program Yeterlilikleri
ÖK: Ders Öğrenme Kazanımları